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Como bien recordamos Claudio Miguel Pizarro Bosio comenzo su carrera en la divisiones menores de la Academia Cantolao, debuto como futbolista profesional en el club Deportivo Pesquero de la ciudad de Chimbote en un encuentro ante Alianza Lima perteneciente a la primera fecha del torneo descentralizado de 1996, en la tercera fecha de aquel campeonato marco sus primeros goles anotando por partida doble frente al Atletico Torino de Talara; en total con el Club Deportivo Pesquero jugo un total de 42 partidos marcando 11 goles.
En 1998 ficho por Alianza Lima, en un encuentro jugado ante Union Minas marco primera y unica vez 5 goles en un partido, para dicho enfrentamiento se encontraban en las tribunas del estadio unos directivos del Club Werder Bremen de Alemania quienes posteriormente ficharon al "bombardero" para que juegue por dicho club; en total con el club Alianza Lima disputo 57 partidos marcando 27 goles.
Ese mismo año, Pizarro realizó una buena campaña en Alemania, siendo considerado el jugador revelación de la temporada. A partir de entonces lo llamaron "El Bombardero de los Andes". En aquél equipo Pizarro usaba la camiseta número 10. En su primer paso por el Club Werder Bremen disputo un total de 76 partidos anotando 38 goles.
En el año 2001 fue contratado por el Bayern Múnich. Su debut no pudo ser más auspicioso, ya que anotó su primer gol con el equipo bávaro apenas a los cuatro minutos de iniciado el encuentro ante el Schalke 04 por la segunda fecha de la Bundesliga 2001-2002. Durante esa temporada, logró convertir 15 goles en la Bundesliga y 4 en la Liga de Campeones de la UEFA. También ganó la Copa Intercontinental disputada en Tokio en diciembre del 2001 luego de que el Bayern Múnich derrotase por 1-0 al Boca Juniors de Argentina.
En total con el club bavaro disputo un total de 252 partidos anotando 100 goles, ademas obtuvo 3 Bundesliga, 3 Copa de Alemania y 2 Copa de Liga.
A mediados de 2007 fue contratado por el club Chelsea de Inglaterra. Tuvo una buena actuación en su debut, marcando su primer gol para el equipo inglés. Con el correr de los partidos, según la prensa especializada, bajó su rendimiento al punto de ser duramente criticado por algunos de los seguidores del club londinense. La relación de Pizarro con la hinchada de ese club no fue de las mejores. El 17 de abril de 2008 el portal goal.com consideró a Pizarro entre los 10 peores fichajes de la temporada en la FA Premier League inglesa, acentuando aún más su peor momento luego de batir el récord histórico como delantero menos prolífico en el Chelsea con solo dos anotaciones. Después de la salida del técnico portugués José Mourinho, Pizarro casi no pudo jugar dado que el técnico de origen israelita Avram Grant lo puso muy poco. Este mismo técnico trajo a su equipo al jugador francés Nicolas Anelka, quitándole posibilidad a Pizarro de ganar más minutos de juego.
En agosto de 2008 fue cedido a préstamo al Werder Bremen, equipo al que regresó luego de 7 años.
En total en su magnifica carrera como futbolista ha disputado hasta el momento 573 partidos anotando 249 goles.
